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特里奇的皇冠app
Dr. Nighat Kokan与Stritch的学生一起进行基因组学研究
斯特里奇是威斯康星州第一个加入基因组学教育伙伴关系的学院或大学.

学生为国家项目贡献新的基因组学研究

遗传学BL308 并没有被列入皇冠app的学术目录中作为一门语言课程,但也许它应该被列入.

在上了一学期的课程后,学生们发现自己能够使用像这样的单词 果蝇grimshawi, 黑腹果蝇, 直接同源, 重叠群, 外显子 当他们沉浸在基因组学中时,他们会很轻松, 生物遗传学对复杂的生物和遗传信息的研究,这些信息能唯一地识别生物体.

学生们不仅学习基因组学, 还能参与到原创研究中来,这要感谢斯特里奇在 基因组学教育伙伴关系该联盟由100多名美国人组成.S. 为本科生提供机会为基因组学研究做贡献的学院和大学. Dr创建. 华盛顿大学圣. 2006年的路易斯, 这一合作关系是通过阿拉巴马大学的赞助而实现的, 华盛顿大学, 国家科学基金会(NSF)和国家卫生研究院(NIH). 2008年,斯特里奇是威斯康星州第一所加入该合作伙伴关系的学校, 这是威斯康星州目前仅有的三所参与研究的学校之一.

“当我们的学生认识到尖端工具,并拥有进行这种类型的计算分析的知识和能力时,他们的装备就更好了,” Dr. Nighat Kokan, 生物学副教授,是基因组学教育伙伴关系的成员,在斯特里奇大学自然科学系的支持下指导学生进行基因组学研究.

特里奇高级 Jose Lizarraga Mazaba 他赞赏Kokan为本科生提供了这种类型的研究经验. 他正在为2021年医学院的严格要求做准备, Lizarraga Mazaba说,这项工作不同于他以前的科学课程, 需要坚持学习注释过程并完成他的个人项目, 特别是在2020年春季学期,课程从当面授课过渡到在线授课.

基因组学是对复杂的生物和遗传信息的研究,这些信息能唯一识别生物体.
学生熟悉基因组概念和数据库.

整个学期, 在投入基因组注释之前,学生要熟悉基因组概念和数据库, 他们分析和识别重叠群上的基因——在测序过程中由一组重叠的DNA片段衍生或构建——专门分配给他们和国家网络中的另一名本科生. 然后,学生将他们的最终结果提交给基因组学教育伙伴关系, 这些发现最终可能会被添加到全国从事遗传学研究的科学家访问的数据库中. 最终,这些学生可能会被列为研究出版物的共同作者.

“每个学生都要完成自己的注释项目,并被分配到自己的果蝇基因组片段进行注释,2020届毕业生梅吉·格里芬说, 主修数学,辅修生物. 注释包括通过利用多个数据库和软件工具来识别DNA中的编码序列,这些工具可以识别可能的坐标候选对象, 然后通过手动检查DNA序列找到编码序列的精确坐标. 一旦找到了项目DNA片段中所有编码序列的精确坐标,并通过了验证模型,项目就完成了.”

“实际上,有十几个不同种类的果蝇(果蝇)的基因组已经被测序,Kokan说. “现有的序列数据使利用基因保存和计算证据注释(一个高度劳动密集型的过程)DNA序列的本科生成为可能."

Kokan说,这个过程对学生来说可能是具有挑战性和令人沮丧的, 尤其是当他们对真正的研究概念还不熟悉的时候, 哪里充满了未知. Lizarraga Mazaba说,他一开始很纠结于研究过程的要求和细节, 他不仅完成了自己的项目,还帮助同学们完成了他们的项目,这让他感到无比满足.

“有时在一天结束的时候,答案并不在那里,”Kokan说. “生活也是如此. 这是现实生活中的情况,因为他们不知道所有的答案, 所以你必须看所有的证据,然后做出最好的判断.”

格里芬说,注释过程发挥了她的长处, 因为在全球大流行期间,所有学习都是虚拟的,需要高度专注和关注细节.

“我认为注释项目对我来说是一个很好的机会, 作为一个对科学数据感兴趣的人, 但这也是一个很好的方式,让更专注于临床或实验室的生物学学生接触到遗传学中正在进行的新型大数据研究,格里芬说, 谁计划在威斯康星大学麦迪逊分校攻读生物医学数据科学硕士学位,为分析人口健康数据的职业生涯做准备.

遗传学BL308是每年春季学期为理科生和辅修生开设的一门高级课程. 这种研究经验是斯特里奇严格的科学课程和项目的组成部分,使像Lizarraga Mazaba和Griffin这样的学生能够立即在科学领域就业或获得高级或专业学位.